“过去18年，用了8次税收杠杆调节资本市场，反映我们对资本市场管理缺乏经验，信心不足，现代金融是一门高超的管理艺术，需要慢慢地去磨合”，吴晓求在肯定政府救市行为时，明确表示资本市场的税收环境应该恰当。
在他看来，中国的资本市场要有很好的发展，必须解决三大问题，包括：大小非解禁、税收环境、再融资的制度建立。
他认为在股权分置改革之初，把大非解禁时间设为三年以上、小非解禁时间设为一年以上，“今天看来时间短了，应该小非解禁三年以上，大非解禁五年甚至十年以上。”他说。
正是由于股权分置改革之初设计时没考虑到，所以现在带来了这么大的问题。“当然，我想这个问题必须解决，战略供给和需求失衡状况不解决，市场就会面临很大的风险。”吴晓求说。
“我希望监管部门把再融资的标准根据新问题、新情况做进一步的细化。现在无论是增发还是发行可转债，再融资只有一个笼统的标准。”他举例说金融企业再融资标准要严格控制在原有净资本的50%以内，而生产型的企业则可以到百分之百。
吴晓求表示还要系统地研究中国资本市场透明度问题，其中最重要的是上市公司信息披露的真实性以及二级市场操纵市场内幕交易的违法行为，要研究其路径和特征，对违法违规行为进行严厉的打击，只有这样才能使中国资本市场走上健康发展之路。
吴晓求认为：“中国的资本市场发展了18年，现在已经进入了一个新的历史阶段，股权分置改革从法律和制度层面上已经完成了，100步走了90步，还有最后艰难的10步没有完成。”
